5 февраля 2019 года ректор Якутской духовной семинарии архиепископ Якутский и Ленский Роман и ректор Московской духовной академии архиепископ Верейский Амвросий  подписали договор о сотрудничестве духовных школ.

Церемония подписания прошла в Елизаветенском зале Московской духовной академии. На ней присутствовали Постоянный представитель Республики Саха (Якутия) при Президенте Российской Федерации А.С. Федотов и заслуженный строитель Республики Саха (Якутия), генеральный директор ООО СК «Главэнергострой» С.Ю. Немировский.

Сотрудничество будет выражаться в создании совместных научных проектов. Вместе духовные учебные заведения будут разрабатывать образовательные программы, выпускать литературу, проводить конференции, семинары и исследования. В рамках договора преподаватели обеих духовных школ смогут повышать квалификацию.

Студенты Московской духовной академии и Якутской духовной семинарии смогут обмениваться учебным и научно-исследовательским опытом.